Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 1700019C18Rik-203ENSMUST00000222085 1766 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc97Q9DBT3 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Il20rb-201ENSMUST00000098458 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms