Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Usp12Q9D9M2 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Usp12Q9D9M2 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
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