Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cldn22Q9D7U6 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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