Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC2

Clps, Colipase, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpsQ9CQC2 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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ClpsQ9CQC2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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ClpsQ9CQC2 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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ClpsQ9CQC2 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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ClpsQ9CQC2 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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ClpsQ9CQC2 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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ClpsQ9CQC2 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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ClpsQ9CQC2 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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ClpsQ9CQC2 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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ClpsQ9CQC2 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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ClpsQ9CQC2 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClpsQ9CQC2 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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