Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms