Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Rnf144aQ925F3 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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