Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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