Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm43122-202ENSMUST00000202259 526 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 AC156274.1-201ENSMUST00000219193 634 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Olfr578-201ENSMUST00000056235 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Gm4883-201ENSMUST00000085702 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Fcrla-203ENSMUST00000159171 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Gm7001-201ENSMUST00000219384 1465 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 AC147366.2-201ENSMUST00000226859 2038 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Gm26913-201ENSMUST00000182391 732 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Pabpc5-202ENSMUST00000113366 2243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Krtap29-1-201ENSMUST00000105051 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Gm12221-201ENSMUST00000125096 1131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Gm16008-203ENSMUST00000181389 480 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Vgll3-202ENSMUST00000227997 1383 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Gm11231-201ENSMUST00000117895 1706 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Gm13197-201ENSMUST00000117204 225 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Rab38-202ENSMUST00000208478 579 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 CT025547.1-201ENSMUST00000225127 578 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Krtap21-1-201ENSMUST00000078422 748 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Hecw1Q8K4P8 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Oosp2-201ENSMUST00000121793 677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms