Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Card11Q8CIS0 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms