Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nup88Q8CEC0 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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