Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms