Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms