Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Htatsf1Q8BGC0 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms