Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms