Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
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Dsg1bQ7TSF1 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Dsg1bQ7TSF1 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Dsg1bQ7TSF1 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Dsg1bQ7TSF1 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Dsg1bQ7TSF1 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Dsg1bQ7TSF1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Dsg1bQ7TSF1 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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Dsg1bQ7TSF1 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms