Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Ptpn7-201ENSMUST00000049449 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop58Q6DFW4 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Limk1-202ENSMUST00000111233 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop58Q6DFW4 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms