Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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Pkp4Q68FH0 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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Pkp4Q68FH0 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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