Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Plxna4os3-201ENSMUST00000127668 269 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Gm37819-201ENSMUST00000194626 1065 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Mbnl1-203ENSMUST00000191747 4046 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptbn2Q68FG2 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms