Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Usp30Q3UN04 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Usp30Q3UN04 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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Usp30Q3UN04 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Usp30Q3UN04 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Usp30Q3UN04 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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Usp30Q3UN04 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Usp30Q3UN04 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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