Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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