Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 CT009721.1-201ENSMUST00000213590 770 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 AC116390.1-201ENSMUST00000227975 670 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ms4a4d-201ENSMUST00000025581 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm28813-201ENSMUST00000186293 1497 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm29324-202ENSMUST00000188242 1497 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm5761-201ENSMUST00000119238 834 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 4930403D09Rik-201ENSMUST00000147359 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms