Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms