Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms