Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Nupl1-202ENSMUST00000041905 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Papolg-202ENSMUST00000102863 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Gm12758-201ENSMUST00000127010 4175 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Gmeb2-201ENSMUST00000049032 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Rab44-201ENSMUST00000087942 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Ano1-203ENSMUST00000121758 4552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Tbccd1-201ENSMUST00000004576 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Fam149b-210ENSMUST00000224721 4483 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Gm7353-201ENSMUST00000069044 2866 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Sypl-202ENSMUST00000076698 4999 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 1700017G19Rik-201ENSMUST00000035860 2437 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Bcas3-206ENSMUST00000108062 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cbx1P83917 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Mbnl3-201ENSMUST00000041495 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Lrrc71-201ENSMUST00000023846 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Cass4-203ENSMUST00000109136 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm43764-201ENSMUST00000202553 3172 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 C330021F23Rik-202ENSMUST00000136592 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Cd22-202ENSMUST00000108125 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Slc7a9-201ENSMUST00000032703 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Mpp2-201ENSMUST00000017458 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Olfr169-204ENSMUST00000216070 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Bhlhe40-201ENSMUST00000032194 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 AC168276.1-201ENSMUST00000218963 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Apol11b-201ENSMUST00000166623 2057 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gimap8-203ENSMUST00000203509 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Pcdhb5-201ENSMUST00000078271 3535 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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