Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm43952-201ENSMUST00000203765 751 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
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PtpreP49446 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtpreP49446 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PtpreP49446 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PtpreP49446 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PtpreP49446 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PtpreP49446 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
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PtpreP49446 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtpreP49446 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PtpreP49446 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PtpreP49446 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PtpreP49446 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PtpreP49446 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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