Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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