Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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