Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
BrafP28028 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
BrafP28028 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
BrafP28028 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
BrafP28028 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
BrafP28028 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BrafP28028 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BrafP28028 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BrafP28028 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
BrafP28028 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
BrafP28028 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
BrafP28028 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
BrafP28028 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
BrafP28028 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
BrafP28028 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
BrafP28028 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
BrafP28028 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
BrafP28028 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BrafP28028 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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BrafP28028 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BrafP28028 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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