Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms