Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Defa-rs1P17533 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Defa-rs1P17533 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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