Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 AC166256.1-201ENSMUST00000219081 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm12696-201ENSMUST00000122361 905 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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