Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Mapk1ip1-202ENSMUST00000118810 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Hdac9-203ENSMUST00000209667 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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DmdP11531 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm16077-201ENSMUST00000121915 655 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm5435-201ENSMUST00000179295 1150 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm29803-201ENSMUST00000205069 375 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Myc-207ENSMUST00000188482 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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DmdP11531 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Tbxas1-206ENSMUST00000162521 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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DmdP11531 Fam162b-201ENSMUST00000020064 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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DmdP11531 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DmdP11531 Rufy3-202ENSMUST00000196686 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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DmdP11531 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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DmdP11531 Gm15535-202ENSMUST00000148478 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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DmdP11531 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 Pln-205ENSMUST00000219921 531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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DmdP11531 Gm26397-201ENSMUST00000083703 134 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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DmdP11531 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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DmdP11531 Scp2-ps2-201ENSMUST00000072166 478 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 Spocd1-201ENSMUST00000084263 3096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 Smarce1-ps1-201ENSMUST00000180067 1077 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 Zfp422-ps-201ENSMUST00000182230 706 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm4891-201ENSMUST00000182279 912 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 1810059H22Rik-202ENSMUST00000203662 546 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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