Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01648 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01648 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P01648 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P01648 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P01648 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P01648 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P01648 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P01648 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P01648 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P01648 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P01648 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P01648 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P01648 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms