Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifnb1P01575 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms