Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sp100O35892 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
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