Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20939L7N243 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms