Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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Gm2056J3QQ02 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Gm2056J3QQ02 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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