Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm21976J3QNN2 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm21976J3QNN2 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm21976J3QNN2 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm21976J3QNN2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm21976J3QNN2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm21976J3QNN2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm21976J3QNN2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm21976J3QNN2 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21976J3QNN2 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms