Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Btn1a1-201ENSMUST00000041674 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Cdkl1-201ENSMUST00000021377 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Galnt1-201ENSMUST00000000430 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Cish-201ENSMUST00000085102 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Vps8-202ENSMUST00000096192 4942 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
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Gm8005F6YKY3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
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Gm8005F6YKY3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
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Gm8005F6YKY3 Cd22-213ENSMUST00000190617 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Slco5a1-204ENSMUST00000136197 5123 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Cpsf1-201ENSMUST00000071898 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 C130036L24Rik-202ENSMUST00000137643 3109 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Brcc3-201ENSMUST00000033544 4310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm8005F6YKY3 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
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