Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms