Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms