Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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