Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm3550W4VSN7 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm3550W4VSN7 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm3550W4VSN7 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm3550W4VSN7 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm3550W4VSN7 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm3550W4VSN7 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm3550W4VSN7 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm3550W4VSN7 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm3550W4VSN7 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm3550W4VSN7 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm3550W4VSN7 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm3550W4VSN7 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm3550W4VSN7 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm3550W4VSN7 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm3550W4VSN7 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm3550W4VSN7 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm3550W4VSN7 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm3550W4VSN7 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms