Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0S3

Mmp17, Matrix metalloproteinase-17, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp17Q9R0S3 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Mmp17Q9R0S3 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Mmp17Q9R0S3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mmp17Q9R0S3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Mmp17Q9R0S3 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Mmp17Q9R0S3 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mmp17Q9R0S3 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mmp17Q9R0S3 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mmp17Q9R0S3 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Mmp17Q9R0S3 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Mmp17Q9R0S3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp17Q9R0S3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp17Q9R0S3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp17Q9R0S3 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Mmp17Q9R0S3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Mmp17Q9R0S3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Mmp17Q9R0S3 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp17Q9R0S3 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp17Q9R0S3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp17Q9R0S3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp17Q9R0S3 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp17Q9R0S3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp17Q9R0S3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp17Q9R0S3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp17Q9R0S3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp17Q9R0S3 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Mmp17Q9R0S3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Mmp17Q9R0S3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp17Q9R0S3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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