Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Klhl1-201ENSMUST00000022666 6645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Gm28042-202ENSMUST00000129685 4472 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Dach2-205ENSMUST00000113382 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Myt1l-205ENSMUST00000218583 4522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Ank3-206ENSMUST00000092434 5886 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Mtor-202ENSMUST00000103221 8564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Cdh23-203ENSMUST00000105462 10592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Higd1aQ9JLR9 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms