Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gtf3c6Q9D8P7 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gtf3c6Q9D8P7 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gtf3c6Q9D8P7 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gtf3c6Q9D8P7 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gtf3c6Q9D8P7 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gtf3c6Q9D8P7 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Nr1i3-208ENSMUST00000155126 2980 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37536-201ENSMUST00000194710 2491 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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