Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Nop56Q9D6Z1 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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