Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Dync1i1-201ENSMUST00000115554 2518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 D3Ertd751e-201ENSMUST00000026867 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Slc2a1-201ENSMUST00000030398 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Scml4-202ENSMUST00000105494 4166 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Fes-208ENSMUST00000206728 2707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Nfia-203ENSMUST00000092532 9382 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Lrba-201ENSMUST00000107635 9888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Bco2-201ENSMUST00000119103 2118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gm44741-201ENSMUST00000207503 2127 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 L1cam-201ENSMUST00000066576 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Radil-202ENSMUST00000085758 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Inpp4a-207ENSMUST00000136846 3576 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Glp2r-201ENSMUST00000021289 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Zfp384-203ENSMUST00000084275 2829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 5830473C10Rik-201ENSMUST00000094615 2308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Traf7-215ENSMUST00000176652 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ccdc83Q9D4V3 1700010I14Rik-203ENSMUST00000151609 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Upb1-201ENSMUST00000039925 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ccdc83Q9D4V3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Phf21a-204ENSMUST00000111290 6332 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Pear1-202ENSMUST00000079083 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Rffl-204ENSMUST00000093975 3575 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Tmem255a-202ENSMUST00000089054 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc136-209ENSMUST00000181464 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Pcdhb6-201ENSMUST00000061717 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 1700006J14Rik-203ENSMUST00000160091 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Rap1gds1-201ENSMUST00000029796 3383 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc83Q9D4V3 Ptk2b-201ENSMUST00000022622 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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