Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Atg3Q9CPX6 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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