Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Atoh8Q99NA2 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Atoh8Q99NA2 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Atoh8Q99NA2 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atoh8Q99NA2 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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